HIV-1 globaalne ja regionaalne molekulaarne epidemioloogia aastatel 1990–2024: süstemaatiline ülevaade, globaalne uuring ja levimuse analüüs

Sissejuhatus

Hiljutises uuringus, mis avaldati ajakirjasLanceti nakkushaigused(2026) pakub seni kõige põhjalikumat globaalset HIV-1 molekulaarse epidemioloogia analüüsi, integreerides süstemaatilise ülevaate andmeid ja ülemaailmse molekulaarse seire uuringu.

Varem kättesaadavate andmekogumite (1990–2021) ja äsja kogutud järjestusandmete kombineerimise abil kaasati uuringusse rohkem kuiAastatel 1990–2024 koguti 154 riigist 1,39 miljonit HIV-1 genotüübi määramise kirjetKasutades UNAIDSi hinnangulist HIV-positiivsete inimeste arvu kaaluteguritena, koostasid teadlased globaalsed ja piirkondlikud kaardid, mis kirjeldavad HIV-1 alatüüpide, ringlevate rekombinantsete vormide (CRF) ja ainulaadsete rekombinantsete vormide (URF) ajalist ja geograafilist jaotust.

Tulemused näitavad, et kuigi HIV-1 alatüübi globaalne maastik on viimase kahe aastakümne jooksul püsinud suhteliselt stabiilsena, toimuvad olulised piirkondlikud nihked, mida eelkõige ajendab rekombinantsete vormide kasvav mitmekesisus ja laienemine.

Uuringu taust

Inimese immuunpuudulikkuse viiruse 1. tüüp (HIV-1) omab ulatuslikku geneetilist mitmekesisust tänu oma kõrgele mutatsioonikiirusele, rekombinatsioonivõimele ja pikaajalisele ülekandedünaamikale.

Sellel geneetilisel varieeruvusel on oluline mõju:

• · molekulaarne jälgimine,
• · diagnostilise toimivuse hindamine,
• · retroviirusevastase resistentsuse jälgimine,
• · ja vaktsiinide väljatöötamise strateegiad.

Uuringu eesmärk oli iseloomustada HIV-1 alatüüpide ja rekombinantsete vormide globaalseid ja piirkondlikke levikumustreid1990–2024, pakkudes ajakohastatud molekulaarset epidemioloogilist raamistikku HIV-i ennetamiseks ja tõrjeks kogu maailmas.

Uuringu ülesehitus ja meetodid

Teadlased viisid läbi süstemaatilise ülevaate PubMedi, Embase'i, Global Healthi ja CINAHLi andmebaasidest, hõlmates 1. jaanuari 2022 ja 22. jaanuari 2025 vahel avaldatud uuringuid.

Lisaks koguti andmeid ülemaailmse HIV-i molekulaarse epidemioloogia koostöövõrgustiku kaudu.

Abikõlblikud andmekogumid olid järgmised:

• · HIV-1 molekulaarse alatüübi teave,
• · selgelt määratletud proovivõtukohad,
• · kogumiskuupäevad,
• · ja piisav valimite arv.

Lõplik andmestik sisaldas:

• · 1 395 222 HIV-1 genotüübi määramise kirjet 
• · 154 riiki 
• · kuus epidemioloogilist perioodi:1990–1999, 2000–2004, 2005–2009, 2010–2014, 2015–2019, 2020–2024.

HIV-1 geneetiliste vormide globaalset ja piirkondlikku levimust hinnati UNAIDS-i järgi korrigeeritud kaalumismeetodite abil.

HIV-1 alatüüpide globaalne levik: alatüüp C jääb domineerivaks

Ajal2020–2024alatüüp C jäi kogu maailmas domineerivaks HIV-1 liiniks, mis moodustas:

Kokku moodustasid rekombinantsed vormid (sh CRF-id ja URF-id) ligikaudu22,4% ülemaailmsetest HIV-1 nakkustest, rõhutades HIV-1 geneetilise mitmekesisuse kasvavat keerukust.

Alatüüp C domineerib jätkuvalt peamiselt järgmistes valdkondades:

• · Lõuna-Aafrika,
• · Lõuna-Aasia,
• · ja mitmed Ida-Aafrika riigid.

Kuna need piirkonnad sisaldavad suurt osa ülemaailmsest HIV-i nakatumiskoormusest, mõjutab alatüübi C domineerimine tugevalt ülemaailmset levikumustrit.

Regionaalsed erinevused: erinevad evolutsioonimustrid mandrite lõikes

Kuigi HIV-1 globaalne struktuur tundub suhteliselt stabiilne, on piirkondlikud mustrid oluliselt muutumas.

Lõuna-Aafrika ja Lõuna-Aasia: püsiv C-alatüübi domineerimine

Lõuna-Aafrikat ja Lõuna-Aasiat iseloomustab endiselt tugevalt C-alatüübi ringlus.

Nendes kõrge koormusega piirkondades moodustab alatüüp C valdavalt ringlevatest viirustest, muutes selle alatüübi C ülemaailmse levimuse peamiseks põhjustajaks.

Samas toob uuring esile ka seda, et molekulaarsete proovide võtmise ulatus mõnes suure koormusega piirkonnas on endiselt piiratud, mis viitab vajadusele täiendavaid seiremeetmeid kohaliku viirusliku mitmekesisuse paremaks tabamiseks.

Põhja-Ameerika ja Ladina-Ameerika: jätkuv B-alatüübi domineerimine

Alatüüp B jääb peamiseks ringlevaks liiniks järgmistes haigustes:

• · Põhja-Ameerika,
• · Ladina-Ameerika.

Need piirkonnad näitavad suhteliselt stabiilseid molekulaarseid epidemioloogilisi mustreid võrreldes piirkondadega, kus alatüüpide üleminekud on kiiremad.

Lääne- ja Kesk-Euroopa: geneetilise mitmekesisuse suurenemine

Lääne- ja Kesk-Euroopas toimub järkjärguline üleminek valdavalt B-alatüübi epideemiast mitmekesisema viirusmaastiku poole.

Peamised trendid hõlmavad järgmist:

• · alatüübi B vähenev osakaal,
• · rekombinantsete vormide osakaalu suurendamine,
• · mitte-B-liinide kasvav esinemine.

Need muutused näitavad, et HIV-1 molekulaarne mitmekesisus muutub üha olulisemaks isegi ajalooliselt alatüübi B domineerivates piirkondades.

Ida-Aasia: rekombinantsete vormide kiire levik

Ida-Aasias täheldati üht olulisemat epidemioloogilist nihet.

Uuring näitas, et:

• · CRF07_BC väärtus suurenes aja jooksul märkimisväärselt,
• · alatüüp B vähenes märkimisväärselt.

CRF07_BC suurenes ligikaudu13,1%-lt aastatel 2000–2004 48,1%-le aastatel 2020–2024, mis näitab olulist muutust piirkondlikus HIV-1 molekulaarses epidemioloogias.

See muutus rõhutab pideva molekulaarse jälgimise olulisust piirkondades, kus rekombinantsed vormid muutuvad domineerivaks.

Rekombinantsed vormid: ülemaailmse HIV-1 mitmekesisuse kasvav komponent

Rekombinantsete vormide osakaal on viimastel aastakümnetel kogu maailmas suurenenud:

• · 2000–2004: ligikaudu 20,8%
• · 2010–2014: ligikaudu 24,2%
• · 2020–2024: ligikaudu 22,4%

Kuigi ülemaailmne osakaal viimasel perioodil veidi vähenes, jätkab rekombinantsete vormide levikut mitmes piirkonnas, eriti järgmistes:

• · Ida-Aasia,
• · Lääne- ja Kesk-Euroopa.

Uuring näitab, et rekombinantseid vorme võidakse mõnes keskkonnas siiski alahinnata, kuna paljud seireprogrammid tuginevad peamiselt osalistele genoomsetele piirkondadele, mis ei pruugi keerulisi rekombinatsioonimustreid täielikult tuvastada.

Seetõttu on oluline tugevdada genoomse seire lähenemisviise, eriti piirkondades, kus on suur HIV-i leviku koormus ja suureneb viiruslik mitmekesisus.

Rahvatervis ja kliinilised tagajärjed

1. Diagnostilised süsteemid vajavad pidevat alamtüüpidevahelist hindamist

HIV-1 geneetilise mitmekesisuse suurenemine rõhutab diagnostiliste tehnoloogiate pideva hindamise olulisust erinevate viiruslike taustade puhul.

Kuigi praegused HIV-i diagnostika ja viiruskoormuse testimise platvormid on näidanud laialdast rakendatavust, on pidev valideerimine uute alatüüpide ja rekombinantsete vormide suhtes endiselt oluline.

Tulevane seire peaks hõlmama järgmist:

• · molekulaarne epidemioloogia,
• · diagnostiline jõudluse jälgimine,
• · ja viirusliku evolutsiooni analüüs.

2. Ravimiresistentsuse jälgimine vajab laiemat geneetilist ulatust

Mitmekesiste HIV-1 liinide laienemine võib mõjutada resistentsusega seotud mutatsioonide tekkimist, avastamist ja tõlgendamist.

Mõned uuringud on näidanud, et teatud HIV-1 liinid, sealhulgas A6/A1-ga seotud variandid, võivad teatud pikatoimelise kabotegraviiri/rilpiviriini ravi korral olla seotud viroloogilise ebaõnnestumise suurenenud riskiga.

Resistentsuse tulemusi mõjutavad aga mitmed tegurid, sealhulgas:

• · algtaseme resistentsusmutatsioonid,
• · ravi ajalugu,
• · järgimine,
• · ja viiruslik geneetiline taust.

Seetõttu on alatüübiteadlik resistentsuse jälgimine üha olulisem.

3. Vaktsiinide väljatöötamisel tuleb arvestada piirkondliku viirusliku mitmekesisusega

HIV-1 ulatuslik geneetiline mitmekesisus on endiselt üks peamisi väljakutseid vaktsiinide väljatöötamisel.

Alatüüpide ja rekombinantsete vormide muutuv levik rõhutab vajadust vaktsiinistrateegiate järele, mis arvestavad:

• · piirkondlikud ringlevad tüved,
• · viiruste evolutsioonilised trendid,
• · ja laiem immuunkaitse.

Globaalselt ühtne lähenemisviis ei pruugi täielikult käsitleda kogu maailmas leviva HIV-1 mitmekesisust.

Kokkuvõte

See HIV-1 molekulaarse epidemioloogia murranguline globaalne analüüs näitab, et ülemaailmset viirusmaastikku iseloomustab nii järjepidevus kui ka muutus.

Kuigi alatüüp C moodustab endiselt peaaegu poole ülemaailmsetest HIV-1 nakkustest, arenevad piirkondlikud molekulaarsed mustrid kiiresti ning rekombinantsed vormid kujundavad üha enam epideemiaid sellistes piirkondades nagu Ida-Aasia ja Euroopa.

Need tulemused kinnitavad püsiva molekulaarse jälgimise, alatüüpidevahelise diagnostilise valideerimise ja integreeritud genoomiliste lähenemisviiside olulisust HIV-i tõhusa ennetamise, ravi jälgimise ja tulevaste vaktsiinide väljatöötamise toetamisel.

Viide

1. HIV-1 globaalne ja regionaalne molekulaarne epidemioloogia aastatel 1990–2024: süstemaatiline ülevaade, globaalne uuring ja levimuse analüüs. Lanceti nakkushaigused, 2026.