—— Zhejiangi CDC, Macro & Micro-Testi ja Hiina CDC koostöös läbi viidud uuring, avaldatud ajakirjas Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
Uuringu ülevaade
2026. aasta mais avaldas ajakiri Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) artikli, mida juhtis Zhejiangi provintsi haiguste tõrje ja ennetamise keskus (Zhejiang CDC), kaasautoriteks bioinformaatika meeskond ettevõttest Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. ja riiklikust nakkushaiguste tõrje ja ennetamise instituudist (Hiina CDC). Uuringu pealkiri on:
"Seitsme Brucella abortus tüve identifitseerimine ja fülogeneetiline analüüs Zhejiangi linnas Hiinas."
See uuring kujutab endast esimest süstemaatilist, täisgenoomil põhinevat fülogeneetilist jälgitavuse analüüsi Brucella abortus'e (B. abortus) kohta Hiinas Zhejiangi provintsis. Meeskond analüüsis seitset isolaati, mis koguti aastatel 2015–2025 (neli inimpäritolu ja kolm veisepäritolu tüve Jinhua, Quzhou ja Ningbo provintsidest). Tulemused pakuvad genoomseid tõendeid selle „põhjapoolse domineeriva liigi” päritolu ja levikuteede kohta Ida-Hiina ebatüüpilises lõunapoolses epideemiapiirkonnas.
Taust ja tähtsus
Brutselloos on zoonoosne haigus, mille põhjustab perekonda Brucella kuuluv bakter. Brucella abortus nakatab peamiselt veiseid, kuid võib põhjustada haigusi ka inimestel. Hiinas on brutselloosil märgatav geograafiline varieeruvus: kõrgeim esinemissagedus esineb põhjapoolsetes provintsides (nt Sise-Mongoolia, Shanxi, Heilongjiang). Seevastu lõunapoolsetes provintsides, sealhulgas Zhejiangi provintsides, on ajalooliselt domineerinud Brucella melitensis, kus B. abortus'e juhtumeid on teatatud väga vähestest. See piirkondlik erinevus muudab B. abortus'e geneetilise iseloomustamise ja päritolu kindlakstegemise Zhejiangi osariigis rahvatervise peamiseks prioriteediks.
Meetodid ja peamised tulemused
Uurimisrühm võttis kasutusele mitmetahulise strateegia, mis ühendas molekulaarbioloogia ja bioinformaatika:
1.Patogeenide identifitseerimine ja põhitüüpimine
BCSP-31 geeni PCR ja AMOS-PCR kinnitasid, et kõik seitse isolaati olid B. abortus.
Üheksa majaphoidse geeni põhjal tehtud multilokusjärjestuse tüpiseerimine (MLST) näitas, et kõik isolaadid kuulusid järjestustüüpi ST2, mis näitab Zhejiangi osariigis ringlevate B. abortus tüvede suurt geneetilist homogeensust.
2.Kogu genoomi iseloomustus
Täisgenoomi sekveneerimine viidi läbi Illumina NovaSeq platvormil. Keskmine nukleotiidide identsuse (ANI) analüüs näitas, et Zhejiangi isolaatidel oli kuni 99,99% sarnasus võrdlustüvega B. abortus 544.
Pangenoomi analüüs näitas väga konserveerunud populatsiooni: identifitseeriti 3084 tuumageeni, lisaks ainult 10 kestgeeni ning pehmeid tuuma- ega pilvegeene ei tuvastatud.
3.Virulentsuse ja antimikroobse resistentsuse geeniprofiilid
Kokku ennustati 68 virulentsusega seotud faktorit, mis hõlmavad klassikalisi radasid, nagu LPS-i biosüntees, T4SS-i sekretsioonisüsteem ja BvrR-BvrS kahekomponendiline regulatsioonisüsteem. Tähelepanuväärne oli, et kõigil isolaatidel puudusid adhesiinigeenid bmaA ja btaF. Resistentsusgeenide analüüs tuvastas CARD-andmebaasis ainult mprF geeni, muid resistentsusdeterminante ei tuvastatud.
4. Fülogeneetiline rekonstruktsioon ja ülekande jälgimine
Tuumagenoomi ühenukleotiidi polümorfismi (cgSNP) analüüs paigutas Zhejiangi isolaadid globaalses fülogeneetilises puus kindlale positsioonile. Tulemused näitasid, et Zhejiangi tüved moodustavad monofüleetilise rühma koos Venemaalt, Mongooliast ja mitmest Põhja-Hiina provintsist (Ningxia, Heilongjiang, Sise-Mongoolia, Hebei, Gansu, Peking) pärit tüvedega. See rühm jaguneb edasi kolmeks eraldi alamklaadiks (klaad 1–3), mis viitab mitmele sõltumatule sissetoomissündmusele.
Järeldused ja mõjud
See uuring pakub esimest suure täpsusega genoomset andmekogumit B. abortus kohta Zhejiangi provintsis ja annab mitu olulist järeldust:
- Klear geneetiline taust– Zhejiangi osariigis ringlevad B. abortus tüved kuuluvad ST2-sse, on genoomiliselt väga konserveerunud ja esindavad tüüpilist veiste brutselloosi liini.
2. Evipiirkondadevahelise ülekande tihedus– Fülogeneetiline analüüs ei toeta iseseisva endeemilise liini olemasolu Zhejiangis. Selle asemel viitavad andmed tugevalt sellele, et need tüved pärinevad Põhja-Hiinast ja neil võib olla ühine evolutsiooniline taust Venemaalt ja Mongooliast pärit tüvedega. Kolme alamklaadi olemasolu viitab mitmele eraldi sissetoomissündmusele.
3. Rahvatervisega seotud mõjud– Need tulemused rõhutavad brutselloosi genoomse seire väärtust isegi traditsiooniliselt mitte-endeemilistes piirkondades, näiteks Zhejiangis. Kuigi praegune juhtumite arv on madal, saavad kõrge resolutsiooniga tööriistad, nagu cgSNP, tõhusalt jälgida imporditud puhangute allikat ja pakkuda teaduslikke tõendeid provintsidevahelise kariloomade transpordiga seotud ülekandeahelate katkestamiseks.
See töö mitte ainult ei täida uurimislünka Zhejiangi provintsis, vaid annab ka uusi lähteandmeid patogeenide seireks ja brutselloosi riskihindamiseks Jangtse jõe delta piirkonnas.
Paberi teave:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … ja Wu, B. (2026). Seitsme Brucella abortus tüve identifitseerimine ja fülogeneetiline analüüs Zhejiangis, Hiinas. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 16, 1758965.
Postituse aeg: 10. juuni 2026