Mitme riigi vastus Andide hantaviiruse klastrile: NAAT ja kogu genoomi sekveneerimine kui kriitilised tööriistad

2026. aasta aprillis Hollandi lipu all sõitev polaarekspeditsiooni kruiisilaevMS Hondiusväljus Ushuaiast Argentinas. 6. aprillil tekkis ühel reisijal palavik ja peavalu ning ta suri pardal viis päeva hiljem. Ka tema naine haigestus ja suri pärast Lõuna-Aafrikasse üleviimist. Seejärel diagnoositi 69-aastasel Briti reisijal hantaviirus ja ta on endiselt intensiivravil. Maailma Terviseorganisatsioon teatas 13. mai seisuga11 juhtumit ja 3 surmajuhtumitseotud laeval toimunud puhanguga.

I. Viiruse ülevaade ja patogeensed tüübid

Hantaviirused on RNA-viiruste rühm, mida levitavad peamiselt närilised ja mis kuulub perekonda Orthohantavirus Bunyaviridae sugukonda. Nende genoom koosnebkolm segmenti (L, M ja S), mis kodeerivad vastavalt RNA-sõltuvat RNA polümeraasi, glükoproteiine ja nukleokapsiidvalku. Geograafilise leviku ja kliiniliste ilmingute põhjal liigitatakse hantaviirused järgmiseltkaks suurt rühma:

Vana Maailma hantaviirused(leidub Euroopas, Aasias ja Aafrikas) põhjustabHemorraagiline palavik koos neerusündroomiga (HFRS)Tüüpiliste viiruste hulka kuuluvad Hantaani viirus (HTNV), Seouli viirus (SEOV) ja Puumala viirus (PUUV). Need on suunatud peamiselt neerudele, põhjustades neerukahjustust, hemorraagilisi ilminguid ja rasketel juhtudel šokki. Suremus varieerub viiruse tüübiti, kuid jääb üldiselt vahemikku<1% kuni 5–15%.

Uue Maailma hantaviirused(levib Põhja- ja Lõuna-Ameerikas) põhjustabHantaviiruse kopsusündroom (HPS)Tüüpiliste viiruste hulka kuuluvad Sin Nombre viirus (SNV) ja Andese viirus (ANDV). Need on suunatud peamiselt kopsudele, põhjustades kiiresti tekkivat mittekardiogeenset kopsuödeemi, rasket hingamisraskust ja südame-veresoonkonna häireid. Esialgsed sümptomid on gripilaadsed (palavik, lihasvalu, seedetrakti kaebused), kuid haigus võib kiiresti progresseeruda hingamispuudulikkuseks koossuremus ulatub 30–50%-ni.

Kruiisilaevade puhangu põhjustas peamiseltAndide viirus (ANDV), mis kuulubHantaviiruse kopsusündroom (HPS)alatüüp.

II. Traditsioonilised HFRS-iga seotud hantaviirused vs. Andide viirus (HPS)

Traditsiooniline HFRS

III. Edastusviisid

Hantaviirus levib peamiseltotsene kokkupuude nakatunud näriliste väljaheidete, sülje või uriinigavõiaerosoolitud väljaheidete sissehingamineMuud võimalikud marsruudid on järgmised:

- Nakatunud näriliste hammustamine või kriimustamine;

- Nakatunud näriliste uriini, väljaheidete või süljega saastunud toidu söömine;

- Silmade, nina või suu puudutamine pärast saastunud esemetega kokkupuudet.

Inimeselt inimesele levik on äärmiselt haruldane, aga on kinnitust leidnudAndide viirus (ANDV).

IV. Hantaviirusega seotud kontaktide globaalne jälgimine – nukleiinhapete testimine ja sekveneerimine põhitehnoloogiatena

Pärast ANDV puhangut käivitasid enam kui kümne riigi – sealhulgas Hispaania, Ühendkuningriigi, Ameerika Ühendriikide, Kanada ja Šveitsi – tervishoiuasutused samaaegselt kontaktide jälgimise ja karantiini jälgimise. Prantsusmaa, Ameerika Ühendriigid ja teised riigid on jätkanud nakatunud laevalt naasnud kodanike tervisliku seisundi jälgimist.

Selles mitut riiki hõlmavas hädaolukorra lahendamisesnukleiinhapete testimine ja genoomne sekveneerimineon mänginud asendamatut põhirolli:

-Nukleiinhappe testimineannab lõplikke tõendeid patogeenide kiireks tuvastamiseks;

-Genoomne sekveneeriminepakub asendamatuid molekulaarseid tõendeid nakkusallika jälgimiseks, ülekandeahelate kinnitamiseks ja viiruslike muutuste hindamiseks.

V. Hantaviiruse (eriti HPS-tüübi) tuvastuslahendused

1. Patogeeni varajane tuvastamine

1.1 Ravikohas testimine (POCT)
Täpne sõeluuring ja erakorraline testimine –proovist tulemuseni 1 tunni jooksul.
Diagnostilised väljakutsed ja kiired molekulaarsed lahendused Ravikoha testimine
1.2 Tavapärane PCR
Tavapärane PCR

2. Järjestuse lahendused

Patogeenide tuvastamiseks ja puhangu jälgimiseks juhtudel, kusteadmata päritoluga palavik, hingamisraskused või hemorraagilised ilmingud.
hemorraagilised ilmingud

Põhifunktsioonid:

Põhifunktsioonid

VI. Kontrollitud jõudlusandmed

Hantaviiruse-positiivsete proovide sondi püüdmisel põhinev täisgenoomi sekveneerimine saavutati>99% genoomi katvus 30× sügavusel.
Kontrollitud jõudlusandmed

Reoveepõhine hantaviiruse genotüüpimine ja alatüüpide osakaalu analüüs on teostatav.
alatüübi osakaal

VII. Seotud komplektid

Seotud komplektid


Postituse aeg: 14. mai 2026