HiljutiHiina CDC nädalalehtavaldas 2025. aasta oktoobris olulise teadusartikli, milles kirjeldati C-grupi rotaviiruse (RVC) põhjustatud ägeda gastroenteriidi puhangu epidemioloogilist ja etioloogilist uurimist Luzhou algkoolis Sichuani provintsis. Märkimisväärselt mängisid uurimises olulist rolli Macro & Micro-Testi suure läbilaskevõimega sihitud patogeenide püüdmise komplekt (sondi püüdmine) ja kogu genoomi rikastamise sekveneerimise tehnoloogia. Võimaldades patogeenide täpset tuvastamist ja põhjalikku genoomset iseloomustamist, andis tehnoloogia kriitilisi teaduslikke tõendeid puhangu kiireks kinnitamiseks, allika täpseks jälgimiseks ja puhangu tõhusaks tõrjeks.
Äkiline puhang: esimene teatatud RVC puhang Edela-Hiinas
15. oktoobril 2025 puhkes Luzhou algkoolis äge gastroenteriidi puhang. Koolis oli kokku 1943 õpilast ja töötajat ning registreeriti 32 haigusjuhtu, sealhulgas 6 laboratoorselt kinnitatud ja 26 kliiniliselt diagnoositud juhtu, mille tulemuseks oli üldine haigestumus 1,65%. Puhang saavutas haripunkti 15. ja 16. oktoobri vahel, kusjuures kõrgeim haigusjuhtude määr oli 7. klassi 5. klassil (23,08%). Enamik patsiente olid kooliealised lapsed (mediaanvanus: 10 aastat), kellel esines peamiselt oksendamist (65,62%), kõhulahtisust (46,87%) ja kõhuvalu (37,50%). Sümptomid kestsid tavaliselt 1–3 päeva ja kõik patsiendid paranesid ilma raskete tüsistusteta.
Epidemioloogiline uurimine tuvastas, et esmane juhtum oli 11-aastane 7. klassi 5. klassi poiss. Tema nooremal õel olid enne teda tekkinud sarnased sümptomid, mis viitab leibkonna kaudu levikule kui esialgsele allikale. Ebapiisav okse käitlemine ülikoolilinnakus – sealhulgas otsene pühkimine ja utiliseerimine ilma õigeaegse desinfitseerimise või ala isoleerimiseta – koos õpilaste kehva kätehügieeniga soodustas tõenäoliselt edasist levikut. Enamik nakatunud klassiruume asus teise ja viienda korruse vahel ning jagas kõrvuti meeste tualette, mis viitab sellele, et nii aerosool- kui ka kontaktülekanne võisid levikule kaasa aidata.
Uurimine muutus eriti keeruliseks, kuna rutiinne patogeenide skriining, sealhulgas noroviiruse ja A-rühma rotaviiruse testid, andsid negatiivseid tulemusi, mis viitab haruldase patogeeni olemasolule.
Etioloogiline diagnoos: makro- ja mikrotesti kogu genoomi sekveneerimine tuvastab süüdlase
Noroviiruse esialgne testimine oli negatiivne. Seejärel kasutas Luzhou CDC kaheksa kliinilise proovi skriinimiseks multipleksset seedetrakti patogeenide reaalajas PCR-testi, mis suudab samaaegselt tuvastada 28 patogeeni, sealhulgas 8 viirust, 17 bakterit ja 3 parasiiti. 17. oktoobril osutusid kuus proovi C-grupi rotaviiruse suhtes positiivseks, tuvastades edukalt põhjustava patogeeni.
Puhangu allika täpsemaks kindlakstegemiseks viisid uurijad läbi nii nanopooride metagenoomse sekveneerimise kui ka Macro & Micro-Testi sondidega püüdva täisgenoomi rikastamise sekveneerimise viiel positiivsel proovil. Selle lähenemisviisiga genereeriti edukalt viis täielikku RVC genoomi järjestust (SC01–SC05). Kiire multipleks-PCR-skriiningu ja sellele järgnenud kõrgresolutsioonilise täisgenoomi sekveneerimise integreeritud strateegia pakkus tugevat tehnilist tuge täpse molekulaarse epidemioloogia ja allika jälgimise jaoks.
Teaduslikud teadmised: M2 genotüübi esmakordne tuvastamine Edela-Hiinas
Macro & Micro-Testi tehnoloogia abil genereeritud kvaliteetsete täisgenoomi andmete põhjal teatas uurimisrühm mitmest olulisest teaduslikust avastusest:
Monoklonaalse puhangu kinnitus:Kõigil viiel viirusisolaadil oli identne kogu genoomi genotüüp (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), kusjuures üksiku nukleotiidi polümorfismi (SNP) osas oli erinevusi vaid 0–1, mis näitab veenvalt, et puhang sai alguse ühest ülekandeahelast.
M2 genotüübi avastamine:Fülogeneetiline analüüs näitas, et Luzhou RVC tüved kuulusid pigem M2 genotüübi kui M3 genotüübi hulka, mida varem peeti Hiina RVC tüvede seas domineerivaks. See leid seab kahtluse alla tavapärase arusaama RVC genotüübi levikust Hiinas ja kinnitab M2 genotüübi tekkimist Edela-Hiinas.
Tõendid rahvusvaheliste ülekandeühenduste kohta:Täisgenoomi võrdlus näitas Luzhou tüvede ja RVC tüvede suurt geneetilist sarnasust, millest varem on teatatud Yunnanis (2025), Novosibirskis Venemaal (2017) ja Itaalias (2012), mis viitab aktiivse Euraasia ülekandevõrgustiku olemasolule.
Ennetamise ja tõrje mõju: varajane avastamine ja kiire sekkumine on olulised
Pärast patogeeni tuvastamist rakendas Luzhou CDC viivitamatult ulatuslikke tõrjemeetmeid, sealhulgas juhtumite isoleerimist, keskkonna desinfitseerimist, oksendamise standardiseeritud ohjamist ja ajutist klassi peatamist. Puhang ohjeldati edukalt ühe inkubatsiooniperioodi jooksul ning pärast 21. oktoobrit ei teatatud ühestki uuest juhtumist.
Uuring annab ka olulise rahvatervisealase õppetunni: klastrite kaupa gastroenteriidi puhangute korral, mille puhul nii A-rühma rotaviiruse kui ka noroviiruse test on negatiivne, tuleks rutiinsesse diagnostilisse sõeluuringusse lisada C-rühma rotaviirus ja teised mitte-A-rühma rotaviirused.
See uuring kujutab endast esimest teatatud C-grupi rotaviiruse puhangut Edela-Hiinas ja esimest M2 genotüübi identifitseerimist piirkonnas, laiendades praegust arusaama RVC epidemioloogiast Ida-Aasias. Selles uuringus näitas Macro & Micro-Testi integreeritud lahendus, mis ühendas multipleks-PCR-sõeluuringu kogu genoomi rikastamise sekveneerimisega, olulist praktilist väärtust, võimaldades nii kiiret patogeenide tuvastamist kui ka kõrgresolutsiooniga molekulaarse allika jälgimist, pakkudes reprodutseeritavat tehnilist raamistikku tulevaste nakkushaiguste puhangute täpseks uurimiseks ja tõrjeks.
Postituse aeg: 30. juuli 2026