Inimese ROS1 fusioongeeni mutatsioon
Toote nimi
HWTS-TM009-inimese ROS1 fusioongeeni mutatsiooni tuvastamise komplekt (fluorestsents-PCR)
Tunnistus
CE
Epidemioloogia
ROS1 on insuliiniretseptorite perekonda kuuluv transmembraanne türosiinkinaas. ROS1 fusioongeen on kinnitust leidnud kui veel üks oluline mitteväikerakulise kopsuvähi juhtgeen. Uue unikaalse molekulaarse alatüübi esindajana on ROS1 fusioongeeni esinemissagedus mitteväikerakulise kopsuvähi korral umbes 1–2%. ROS1 läbib peamiselt geenide ümberkorraldusi eksonites 32, 34, 35 ja 36. Pärast liitmist selliste geenidega nagu CD74, EZR, SLC34A2 ja SDC4 jätkab see ROS1 türosiinkinaasi piirkonna aktiveerimist. Ebanormaalselt aktiveeritud ROS1 kinaas võib aktiveerida allavoolu signaaliülekandeteid, nagu RAS/MAPK/ERK, PI3K/Akt/mTOR ja JAK3/STAT3, osaledes seeläbi kasvajarakkude proliferatsioonis, diferentseerumises ja metastaasides ning põhjustades vähki. ROS1 fusioonmutatsioonide hulgas moodustab CD74-ROS1 umbes 42%, EZR umbes 15%, SLC34A2 umbes 12% ja SDC4 umbes 7%. Uuringud on näidanud, et ROS1 kinaasi katalüütilise domeeni ATP-sidumiskoha ja ALK kinaasi ATP-sidumiskoha homoloogia on kuni 77%, seega on ALK türosiinkinaasi väikemolekuli inhibiitoril krizotiniibil ja nii edasi ilmne raviv toime mitteväikerakk-kopsuvähi ravis ROS1 fusioonmutatsiooniga. Seetõttu on ROS1 fusioonmutatsioonide tuvastamine krizotiniibi ravimite kasutamise eelduseks ja aluseks.
Kanal
FAM | Reaktsioonipuhver 1, 2, 3 ja 4 |
VIC(HEX) | Reaktsioonipuhver 4 |
Tehnilised parameetrid
Ladustamine | ≤-18 ℃ |
Säilivusaeg | 9 kuud |
Proovi tüüp | parafiiniga kaetud patoloogilise koe või viilutatud proovid |
CV | <5,0% |
Ct | ≤38 |
LoD | See komplekt suudab tuvastada fusioonmutatsioone kuni 20 koopiani. |
Kohaldatavad instrumendid: | Applied Biosystems 7500 reaalajas PCR-süsteemidApplied Biosystems 7500 kiired reaalajas PCR-süsteemid SLAN ®-96P reaalajas PCR-süsteemid QuantStudio™ 5 reaalajas PCR-süsteemid LightCycler®480 reaalaja PCR-süsteem LineGene 9600 Plus reaalajas PCR-i tuvastussüsteem MA-6000 reaalajas kvantitatiivne termotsükler BioRad CFX96 reaalajas PCR-süsteem BioRad CFX Opus 96 reaalajas PCR-süsteem |
Töövoog
Soovitatav ekstraheerimisreaktiiv: RNeasy FFPE komplekt (73504) firmalt QIAGEN, parafiiniga kaetud koesektsioonide kogu RNA ekstraheerimiskomplekt (DP439) firmalt Tiangen Biotech (Beijing) Co.,Ltd.