Kuus tüüpi hingamisteede patogeene
Toote nimi
HWTS-OT058A/B/C/Z – reaalajas fluorestseeruv RT-PCR komplekt kuue hingamisteede patogeeni tuvastamiseks
Tunnistus
CE
Epidemioloogia
Koroonaviirushaigus 2019, mida nimetatakse ka "COVID-19", viitab SARS-CoV-2 infektsiooni põhjustatud kopsupõletikule. SARS-CoV-2 on β-perekonda kuuluv koroonaviirus. COVID-19 on äge hingamisteede nakkushaigus ja elanikkond on üldiselt vastuvõtlik. Praegu on nakkusallikaks peamiselt SARS-CoV-2-ga nakatunud patsiendid ja ka asümptomaatilised nakatunud isikud võivad nakkusallikaks saada. Praeguse epidemioloogilise uuringu põhjal on inkubatsiooniperiood 1–14 päeva, enamasti 3–7 päeva. Peamised ilmingud on palavik, kuiv köha ja väsimus. Mõnel patsiendil esines ninakinnisust, nohu, kurguvalu, lihasvalu ja kõhulahtisust.
Gripp, mida tuntakse ka kui "grippi", on äge hingamisteede nakkushaigus, mille põhjustab gripiviirus. See on väga nakkav. See levib peamiselt köhimise ja aevastamise teel. Tavaliselt puhkeb see kevadel ja talvel. Gripiviirused jagunevad A-, IFV A-, B-, IFV B- ja C-grippi, millest IFV C on kolm tüüpi, kõik kuuluvad kleepuvate viiruste hulka, mis põhjustavad inimeste haigusi peamiselt A- ja B-gripiviirused. See on üheahelaline segmenteeritud RNA-viirus. A-gripiviirus on äge hingamisteede infektsioon, sealhulgas H1N1, H3N2 ja teised alatüübid, mis on altid mutatsioonidele ja puhangutele kogu maailmas. "Nihe" viitab A-gripiviiruse mutatsioonile, mille tulemuseks on uue viiruse "alatüübi" teke. B-gripiviirused jagunevad kahte liini: Yamagata ja Victoria. B-gripiviirusel on ainult antigeenne triiv ja see väldib inimese immuunsüsteemi jälgimist ja elimineerimist mutatsiooni kaudu. B-gripiviiruse evolutsioonikiirus on aga aeglasem kui inimese A-gripiviirusel. B-tüüpi gripiviirus võib põhjustada ka inimeste hingamisteede infektsioone ja viia epideemiateni.
Adenoviirus (AdV) kuulub imetajate adenoviiruse hulka, mis on kaheahelaline DNA-ga viirus ilma ümbriseta. Leitud on vähemalt 90 genotüüpi, mis võib jagada AG 7 alamperekonda. AdV-nakkus võib põhjustada mitmesuguseid haigusi, sealhulgas kopsupõletikku, bronhiiti, tsüstiiti, silma konjunktiviiti, seedetrakti haigusi ja entsefaliiti. Adenoviiruse kopsupõletik on üks raskemaid kogukonnas omandatud kopsupõletiku tüüpe lastel, moodustades umbes 4–10% kogukonnas omandatud kopsupõletikust.
Mycoplasma pneumoniae (MP) on väikseim prokarüootne mikroorganism, mis paikneb bakteri ja viiruse vahepeal, millel on rakuline struktuur, kuid puudub rakukest. MP põhjustab peamiselt inimeste hingamisteede infektsioone, eriti lastel ja noortel. See võib põhjustada inimese mükoplasma kopsupõletikku, laste hingamisteede infektsioone ja atüüpilist kopsupõletikku. Kliinilised ilmingud on mitmekesised, millest enamik on tugev köha, palavik, külmavärinad, peavalu ja kurguvalu. Kõige levinumad on ülemiste hingamisteede infektsioon ja bronhide kopsupõletik. Mõnedel patsientidel võib ülemiste hingamisteede infektsioon areneda raskeks kopsupõletikuks, mis võib põhjustada rasket hingamisraskust ja surma.
Respiratoorne süntsütiaalviirus (RSV) on RNA-viirus, mis kuulub paramyxoviridae perekonda. See levib õhus olevate tilkade ja lähikontakti kaudu ning on imikute alumiste hingamisteede infektsioonide peamine patogeen. RSV-ga nakatunud imikutel võib tekkida raske bronhioliit (nimetatakse bronhioliidiks) ja kopsupõletik, mis on lastel seotud astmaga. Imikutel on rasked sümptomid, sealhulgas kõrge palavik, riniit, farüngiit ja larüngiit ning seejärel bronhioliit ja kopsupõletik. Mõnedel haigetel lastel võivad tekkida tüsistused keskkõrvapõletiku, pleuriidi ja müokardiidiga jne. Ülemiste hingamisteede infektsioon on täiskasvanute ja vanemate laste peamine infektsiooni sümptom.
Kanal
Kanali nimi | R6 reaktsioonipuhver A | R6 reaktsioonipuhver B |
FAM | SARS-CoV-2 | HAdV |
VIC/HEX | Sisekontroll | Sisekontroll |
CY5 | Jalgrattasõit A | MP |
ROX | Jalaväe lahinguvälja B | RSV |
Tehnilised parameetrid
Ladustamine | Vedelik: ≤-18 ℃ pimedas; Lüofiliseeritud: ≤30 ℃ pimedas |
Säilivusaeg | Vedelik: 9 kuud; lüofiliseeritud: 12 kuud |
Proovi tüüp | Täisveri, plasma, seerum |
Ct | ≤38 |
CV | ≤5,0% |
LoD | 300 koopiat/ml |
Spetsiifilisus | Ristreaktiivsuse tulemused näitasid, et komplekti ja inimese koroonaviiruse SARSr-CoV, MERSr-CoV, HCoV-OC43, HCoV-229E, HCoV-HKU1, HCoV-NL63, paragripiviiruse tüüpide 1, 2, 3, rinoviirus A, B, C, klamüüdia pneumoniae, inimese metapneumoviiruse, enteroviirus A, B, C, D, inimese kopsuviiruse, Epsteini-Barri viiruse, leetriviiruse, inimese tsütomegaloviiruse, rotaviiruse, noroviiruse, mumpsiviiruse, tuulerõugeviiruse, legionella, bordetella pertussise, Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureuse, streptococcus pneumoniae, S. pyogenese, Klebsiella pneumoniae, Mycobacterium tuberculosis'e, suitsuaspergilluse, Candida albicans'i, Candida glabrata, pneumocystis jiroveci ja vastsündinu krüptokoki ning inimese genoomse nukleiinhappe vahel ristreaktsiooni ei esinenud. |
Kohaldatavad instrumendid | See suudab võrrelda turul saadaolevate tavaliste fluorestseeruvate PCR-instrumentidegaSLAN-96P reaalajas PCR-süsteemid ABI 7500 reaalajas PCR-süsteemid ABI 7500 kiired reaalajas PCR-süsteemid QuantStudio®5 reaalajas PCR-süsteemi Valgustsükliga®480 reaalajas PCR-süsteemi LineGene 9600 Plus reaalajas PCR-i tuvastussüsteemid MA-6000 reaalajas kvantitatiivne termotsükler BioRad CFX96 reaalajas PCR-süsteem, BioRad CFX Opus 96 reaalajas PCR-süsteem |