Inimese EGFR geeni 29 mutatsioonide tuvastamise komplekt (fluorestsents-PCR) - RUO
Toote nimi
Inimese EGFR geeni 29 mutatsioonide tuvastamise komplekt (fluorestsents-PCR) - RUO
Epidemioloogia
Kopsuvähist on saanud kogu maailmas vähiga seotud surmade peamine põhjus, mis ohustab tõsiselt inimeste tervist. Mitteväikerakuline kopsuvähk moodustab umbes 80–85% kopsuvähihaigetest. EGFR on praegu mitteväikerakulise kopsuvähi ravis kõige olulisem molekulaarne sihtmärk. EGFR-i fosforüülimine võib soodustada kasvajarakkude kasvu, diferentseerumist, invasiooni, metastaase, apoptoosivastast toimet ja soodustada kasvaja angiogeneesi. EGFR-i türosiinkinaasi inhibiitorid (TKI) võivad blokeerida EGFR-i signaaliülekande rada, pärssides EGFR-i autofosforüülimist, pärssides seeläbi kasvajarakkude proliferatsiooni ja diferentseerumist, soodustades kasvajarakkude apoptoosi, vähendades kasvaja angiogeneesi jne, et saavutada kasvajale suunatud ravi [1]. Suur hulk uuringuid on näidanud, et EGFR-TKI terapeutiline efektiivsus on tihedalt seotud EGFR-i geenimutatsiooni staatusega ja võib spetsiifiliselt pärssida EGFR-i geenimutatsiooniga kasvajarakkude kasvu [2,3]. EGFR-i geen asub 7. kromosoomi lühikesel harul (7p12), selle täispikkus on 200 kb ja see koosneb 28 eksonist. Mutatsioonipiirkond asub peamiselt eksonites 18 kuni 21, koodonites 746 kuni 753 moodustab deletsioonmutatsioon eksonil 19 umbes 45% ja L858R mutatsioon eksonil 21 umbes 40–45% [4]. NCCN-i mitteväikerakulise kopsuvähi diagnoosimise ja ravi juhised sätestavad selgelt, et enne EGFR-TKI manustamist on vaja EGFR-geeni mutatsiooni testimist. Seda testikomplekti kasutatakse epidermaalse kasvufaktori retseptori türosiinkinaasi inhibiitori (EGFR-TKI) ravimite manustamise juhendamiseks ja see annab aluse personaalsele meditsiinile mitteväikerakulise kopsuvähiga patsientidele. Seda komplekti kasutatakse ainult EGFR-geeni levinud mutatsioonide tuvastamiseks mitteväikerakulise kopsuvähiga patsientidel. Testi tulemused on ainult kliiniliseks võrdluseks ja neid ei tohiks kasutada patsientide individuaalse ravi ainsa alusena. Arstid peaksid arvestama patsiendi seisundi, ravimite näidustuste ja raviga. Testi tulemuste igakülgseks hindamiseks kasutatakse reaktsiooni ja muid laboratoorsete testide näitajaid ning muid tegureid.
Kanal
| Reaktsioonipuhver | Kanal |
| EGFR IC reaktsioonipuhver | FAM-kanal |
| L858R reaktsioonipuhver | FAM-kanal |
| 19del reaktsioonipuhver | FAM-kanal |
| T790M reaktsioonipuhver | FAM-kanal |
| G719X reaktsioonipuhver | FAM-kanal |
| 3Ins20 reaktsioonipuhver | FAM-kanal |
| L861Q reaktsioonipuhver | FAM-kanal |
| S768I reaktsioonipuhver | FAM-kanal |
Tehnilised parameetrid
| Ladustamine | Vedelik: ≤ -18 ℃ pimedas |
| Säilivusaeg | 12 kuud |
| Proovi tüüp | värske kasvajakude, külmutatud patoloogiline lõik, parafiiniga kaetud patoloogiline kude või lõik, plasma või seerum |
| CV | <5,0% |
| LoD | nukleiinhappe reaktsioonilahuse tuvastamine 3ng/μL metsiktüüpi taustal suudab stabiilselt tuvastada 1% mutatsioonikiirust; b) nukleiinhappe reaktsioon 1% mutatsioonikiiruse korral saab metsiktüüpi taustal 1×105 koopiat/ml stabiilselt tuvastada mutatsiooni 1×103 koopiat/ml; c) Sisemine referentsreaktsioonilahus suudab tuvastada referentstoode SW3 ettevõtte sisemise referentsi madalaima avastamispiiriga. Kui komplekt tuvastab riikliku avastamispiiri referentsmaterjali, saab stabiilselt tuvastada 2,5% mutatsioonisageduse avastamispiiri referentsmaterjali ja EGFR geeni amplifikatsioonimutatsiooni koopiaarvu variatsiooniga 4. |
| Spetsiifilisus | Metsiktüüpi inimese genoomse DNA ja teiste mutantide tüüpidega ristreaktsiooni ei esine. |
| Kohaldatavad instrumendid | Applied Biosystems 7500 reaalajas PCR-süsteemid, Applied Biosystems 7300 reaalajas PCR-süsteemid, QuantStudio® 5 reaalaja PCR-süsteemid, LightCycler® 480 reaalaja PCR-süsteem, BioRad CFX96 reaalaja PCR-süsteem. |
Töövoog
Vajalikud, kuid komplekti mittekuuluvad reagendid:DNaasi/RNaasi vaba vesi, veevaba etanool. Parafiini sisestatud koeproovi testimisel on soovitatav kasutada QIAGEN-i QIAamp DNA FFPE koekomplekti (56404) ja Tiangen Biotech (Beijing) Co., Ltd. parafiini sisestatud koe-DNA kiirekstraktsioonikomplekti (DP330). Plasma/seerumi proovi testimisel on soovitatav kasutada Jiangsu Macro & Micro-Test üldist DNA/RNA komplekti (HWTS-3019-50, HWTS-3019-32, HWTS-3019-48, HWTS-3019-96) (mida saab kasutada koos Macro & Micro-Test automaatse nukleiinhappe ekstraktoriga (HWTS-3006C, HWTS-3006B)) või QIAGEN-i QIAamp tsirkuleeriva nukleiinhappe komplekti (55114).
Vajalikud, kuid mitte kaasasolevad tarbekaubadDNaasi/RNaasi vabad otsikud, ühekordsed kindad, DNaasi/RNaasi vaba tsentrifuugituub, 8 PCR-tuubi ribad, tsentrifuug.








